More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0593 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0593  peptide ABC transporter, permease  100 
 
 		 321 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2541  peptide transport system permease  38.41 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1783  peptide ABC transporter, permease protein SapB  38.41 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.359002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1829  peptide ABC transporter, permease protein SapB  36.9 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01270  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  37.24 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.863353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1529  peptide ABC transporter, permease protein SapB  37.24 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.453329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01281  hypothetical protein  37.24 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.875728  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1407  peptide ABC transporter, permease protein SapB  37.24 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.40561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.522006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1934  peptide ABC transporter, permease protein SapB  37.24 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0764041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1500  peptide ABC transporter, permease protein SapB  37.24 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1817  peptide ABC transporter permease protein SapB  37.93 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000118428 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1639  peptide ABC transporter permease SapB  37.93 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000008578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1457  peptide ABC transporter, permease protein SapB  37.93 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.74362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1879  peptide ABC transporter permease SapB  37.93 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0672525  hitchhiker  0.00363976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1818  peptide transport system permease SapB  37.93 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.350212  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003817  peptide transport system permease protein SapB  37.13 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0406773 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0478  peptide transport system permease protein SapB  35.91 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01869  hypothetical protein  34.58 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1286  peptide ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000884166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.419421  hitchhiker  0.0000256844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02836  peptide transport protein (ABC superfamily, membrane)  33.09 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.996843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.526476  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 		 343 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.79718  normal  0.337893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3776  peptide ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 		 343 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 		 343 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1804  peptide ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.887279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2193  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  31.68 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1234  peptide ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  31.23 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.098131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  30.63 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  32.12 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  30.86 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  32.1 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.14 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  31 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  31.23 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  31.23 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  30.86 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  30.86 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  29.37 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.36 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  27.16 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  28.26 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  29.04 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  28.26 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  31 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  29.41 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  29.63 
 
 		 334 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  29 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  29 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  27.64 
 
 		 351 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  29 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.61 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  28.21 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  28.62 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.09 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  27.11 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  28.41 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  29.93 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  28.41 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  27.25 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>