More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1286 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1286  peptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 320 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01869  hypothetical protein  75.94 
 
 		 320 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003817  peptide transport system permease protein SapB  74.69 
 
 		 320 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0478  peptide transport system permease protein SapB  59.69 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1783  peptide ABC transporter, permease protein SapB  49.84 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2541  peptide transport system permease  49.84 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 		 321 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.78 
 
 		 321 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.359002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01270  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  49.22 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.22 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.522006 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.22 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.863353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1500  peptide ABC transporter, permease protein SapB  49.22 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1529  peptide ABC transporter, permease protein SapB  49.22 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.453329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1934  peptide ABC transporter, permease protein SapB  49.22 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0764041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1407  peptide ABC transporter, permease protein SapB  49.22 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.40561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01281  hypothetical protein  49.22 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.875728  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1829  peptide ABC transporter, permease protein SapB  49.22 
 
 		 321 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.67 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 		 321 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0406773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.34 
 
 		 321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1817  peptide ABC transporter permease protein SapB  50 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000118428 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1639  peptide ABC transporter permease SapB  50 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000008578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1879  peptide ABC transporter permease SapB  50 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0672525  hitchhiker  0.00363976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1457  peptide ABC transporter, permease protein SapB  50 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.74362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1818  peptide transport system permease SapB  49.67 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.350212  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3776  peptide ABC transporter, permease protein  42.8 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119537  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  34.62 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  34.02 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  35.01 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  34.72 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  35.5 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  33.04 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 335 aa  211  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  34.41 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.419421  hitchhiker  0.0000256844 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  33.53 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  33.92 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  33.53 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  33.92 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.62 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  33.92 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  33.92 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  32.94 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  34.42 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  33.92 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  33.04 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  33.63 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  33.63 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  33.63 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  33.63 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  33.63 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  33.63 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.94 
 
 		 336 aa  208  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  33.63 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  33.63 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  33.23 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  33.04 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  35.29 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  33.63 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  35.29 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  32.65 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  35.29 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  35.29 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 		 343 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  32.05 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  32.05 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.99 
 
 		 343 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  33.04 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  34.62 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.79718  normal  0.337893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.51 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  32.74 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  34.02 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  32.74 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  34.02 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0593  peptide ABC transporter, permease  33.97 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 		 343 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.526476  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02836  peptide transport protein (ABC superfamily, membrane)  38.32 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.996843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>