More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3157 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 325 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  96.62 
 
 		 325 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  84.26 
 
 		 325 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.08 
 
 		 325 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320592 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65 
 
 		 324 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.54 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.23 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.5 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.8 
 
 		 324 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.03 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.38 
 
 		 325 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.77 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1882  peptide ABC transporter transmembrane protein  60.99 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0184491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.22 
 
 		 315 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.73 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00239771  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2538  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.48 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000540331  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2810  peptide ABC transporter, permease protein  56.17 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199712  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.92 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.37 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1241  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.55 
 
 		 323 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.59 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.642958  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 		 328 aa  318  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7193  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  48.44 
 
 		 326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.77 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 		 327 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.34 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.1 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.365334  normal  0.156098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  44.2 
 
 		 327 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.71 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508516  normal  0.0813716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2856  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  41.69 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00494  ABC transporter permease component  39.25 
 
 		 325 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000247365  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0096  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  38.01 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0563  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  40.5 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 		 321 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2565  peptide ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.304242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  40.06 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  40.77 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.000255832  decreased coverage  0.000142665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 		 336 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001973  peptide ABC transporter permease component  39.22 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  39.05 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  39.17 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  39.17 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  39.58 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  39.58 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.14 
 
 		 336 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.44 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  38.02 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  38.69 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  38.39 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  38.39 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  38.46 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  38.46 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  38.39 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 		 334 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.69 
 
 		 339 aa  238  8e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  38.39 
 
 		 339 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  39.76 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.44 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  39.76 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  36.94 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00059192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.64 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.166982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>