More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5038 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.07 
 
 		 324 aa  634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 325 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.642958  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.22 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  48.1 
 
 		 325 aa  311  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.59 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.76 
 
 		 324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.75 
 
 		 323 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1882  peptide ABC transporter transmembrane protein  46.33 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0184491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.17 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00239771  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2538  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.96 
 
 		 324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000540331  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2810  peptide ABC transporter, permease protein  43.65 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1241  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.44 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 326 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  39.06 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 		 326 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7193  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.12 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00494  ABC transporter permease component  37.15 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  38.46 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  37.87 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  37.87 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  37.54 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  37.87 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  37.87 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  37.57 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  37.28 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  37.28 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  37.28 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  37.28 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  37.28 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  37.28 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  37.28 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  37.28 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508516  normal  0.0813716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  37.28 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  37.28 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  36.98 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  36.98 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0096  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  35.6 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.24 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2565  peptide ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.304242  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.365334  normal  0.156098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001973  peptide ABC transporter permease component  36.69 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 391 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  36.5 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2856  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  34.38 
 
 		 326 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  36.2 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  36.2 
 
 		 339 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.2 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.53 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  35.91 
 
 		 335 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  36.04 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0563  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  33.54 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  36.67 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  36.78 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  37.83 
 
 		 336 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  35.74 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  35.74 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  36.67 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000247365  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.44 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  36.47 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  36.36 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  35.44 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 		 336 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  37.5 
 
 		 336 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>