More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0686 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.69 
 
 
327 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
327 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.58 
 
 
326 aa  583  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.24 
 
 
326 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.38 
 
 
326 aa  562  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.85 
 
 
326 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508516  normal  0.0813716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  77.12 
 
 
327 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.5 
 
 
327 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.41 
 
 
328 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63 
 
 
326 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2856  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  64.89 
 
 
326 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.19 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.18 
 
 
326 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7193  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  61.25 
 
 
326 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.52 
 
 
338 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.365334  normal  0.156098 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.75 
 
 
322 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.000255832  decreased coverage  0.000142665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.68 
 
 
321 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.44 
 
 
321 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  47.08 
 
 
391 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0563  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  45.23 
 
 
325 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0096  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  41.85 
 
 
325 aa  295  8e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00494  ABC transporter permease component  42.9 
 
 
325 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
349 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00059192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.31 
 
 
325 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
323 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.53 
 
 
324 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
325 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2565  peptide ABC transporter, permease protein  42.9 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.304242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
326 aa  288  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 
325 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
349 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
325 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  44.06 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
325 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.38 
 
 
325 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 
324 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000247365  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 
325 aa  278  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.19 
 
 
323 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740453  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001973  peptide ABC transporter permease component  42.72 
 
 
310 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
324 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
327 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 
325 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
334 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.96 
 
 
333 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
315 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1882  peptide ABC transporter transmembrane protein  42.59 
 
 
328 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0184491  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  40.94 
 
 
339 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
324 aa  249  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
320 aa  248  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
334 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
308 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  40.48 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
316 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
306 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
325 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.642958  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1241  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.2 
 
 
323 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 
306 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
333 aa  239  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  41.14 
 
 
336 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  40.84 
 
 
336 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  41.14 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
324 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
335 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
306 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
308 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.87491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 
324 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00239771  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  40.84 
 
 
336 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
336 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.24 
 
 
336 aa  235  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  40.12 
 
 
337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  40.81 
 
 
314 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  40.54 
 
 
336 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
335 aa  232  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
335 aa  232  7.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
308 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
332 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
313 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  40.24 
 
 
336 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  41.14 
 
 
336 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  38.12 
 
 
306 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  38.12 
 
 
306 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
306 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  41.14 
 
 
336 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
314 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2185  ABC transporter, inner membrane subunit  43.57 
 
 
309 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
306 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
321 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
306 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.84 
 
 
336 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  38.12 
 
 
306 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  38.12 
 
 
306 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>