More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2407 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 306 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.2 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.52 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6467  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  47.33 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 308 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  45.21 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.21 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  41.32 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  44.23 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 		 335 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  43.15 
 
 		 335 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  42.86 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 		 305 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.43 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  44.23 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 		 313 aa  251  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.23 
 
 		 307 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30112  hitchhiker  0.0000547502 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  40.06 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  42.01 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  43.59 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  43.59 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  41.75 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  43.59 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.59 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.67 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  normal  0.480947 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  41.75 
 
 		 314 aa  248  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.59 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  40.65 
 
 		 336 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.122408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 		 312 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5402  Nickel-transporting ATPase  43.23 
 
 		 304 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997864  hitchhiker  0.00986644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  40.36 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  40.36 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.19 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  40.47 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  42.21 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  39.76 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  43.77 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  40.76 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  40.76 
 
 		 339 aa  242  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.99 
 
 		 313 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 		 308 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  39.64 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.440678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.19 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  40.77 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00227736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.77 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0396577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.35 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  40.68 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  39.47 
 
 		 336 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 		 334 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 		 326 aa  237  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  39.59 
 
 		 339 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.91 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.87 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.67 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.373349  normal  0.751724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  39.3 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  39.3 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  39.3 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  39.3 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  39.76 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>