More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5402 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5402  Nickel-transporting ATPase  100 
 
 
304 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997864  hitchhiker  0.00986644 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.7 
 
 
304 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.440678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.05 
 
 
304 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.2 
 
 
307 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.373349  normal  0.751724 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.21 
 
 
305 aa  363  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310783  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.66 
 
 
309 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51287  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 
309 aa  287  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0359534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
305 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238423  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.84 
 
 
306 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 
305 aa  255  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
306 aa  244  9e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
306 aa  225  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
306 aa  219  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
313 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
321 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
306 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
308 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
306 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
334 aa  205  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
321 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
321 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
321 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
313 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
321 aa  203  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
321 aa  201  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
311 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
304 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  36.04 
 
 
339 aa  199  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  35.51 
 
 
324 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.41 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.41 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.41 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.41 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.41 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  35.41 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  35.41 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  35.41 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
314 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
335 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
321 aa  195  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
309 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
315 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.08 
 
 
306 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  35.08 
 
 
306 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
314 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  35.08 
 
 
306 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
313 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
311 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  35.08 
 
 
306 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
316 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
307 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00227736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
312 aa  193  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
313 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
313 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
318 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
313 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
315 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
306 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.1 
 
 
313 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  37.38 
 
 
313 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.94 
 
 
315 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
306 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  34.98 
 
 
316 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
309 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
308 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
313 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  35.16 
 
 
306 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  35.16 
 
 
306 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  35.16 
 
 
306 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.16 
 
 
306 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 
306 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.36 
 
 
313 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
326 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
307 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
316 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  35.93 
 
 
336 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  35.93 
 
 
336 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  35.33 
 
 
336 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
315 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  35.63 
 
 
336 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  33.01 
 
 
313 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
326 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
305 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.37 
 
 
324 aa  185  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
306 aa  185  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
307 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.87491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>