More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1951 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 305 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238423  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.34 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.82 
 
 		 307 aa  311  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.373349  normal  0.751724 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.5 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.85 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.34 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51287  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.52 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0359534 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5402  Nickel-transporting ATPase  45.54 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997864  hitchhiker  0.00986644 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.2 
 
 		 304 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.440678 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 		 306 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6467  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  38.61 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.74 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  36.98 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0396577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2185  ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  35.9 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 		 324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  35.22 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 		 316 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 321 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.39 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.3 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  34.64 
 
 		 339 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.16 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  38.39 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  35.6 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  35.28 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.473932  normal  0.177469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  35.9 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30112  hitchhiker  0.0000547502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  36.68 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  35.6 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  35.5 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  35.5 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  35.5 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  35.5 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  35.5 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  35.5 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  35.5 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  35.5 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  34.83 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  35.18 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3776  peptide ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119537  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  34.18 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  34.18 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  34.18 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.122408 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.18 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  32.43 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  35.93 
 
 		 336 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>