More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4456 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 307 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30112  hitchhiker  0.0000547502 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.13 
 
 		 319 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.23 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  42.02 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  40.07 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 		 316 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  40.13 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  40.13 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  43.12 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  40.13 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  40.13 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  41.69 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  41.04 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  40.07 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  40.72 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2185  ABC transporter, inner membrane subunit  45.6 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.16 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  40.39 
 
 		 305 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 		 316 aa  232  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 		 307 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.16 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  39.16 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.16 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  38.31 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.16 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.16 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1322  nickel transport system permease protein NikB  36.48 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00196564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  38.83 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 		 322 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  38.83 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  38.83 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  38.83 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  38.83 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  41.04 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  38.83 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  38.83 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  38.83 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.07 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  38.83 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 		 306 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.46 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 		 313 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  38.83 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.122408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  39.81 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.13 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3006  nickel transporter permease NikB  39.16 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0438476  normal  0.3014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 		 324 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00994535  normal  0.14386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6467  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  39.42 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.54 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3343  nickel transporter permease NikB  38.83 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  38.92 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 		 314 aa  222  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  36.14 
 
 		 325 aa  221  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  41.83 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  41.83 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  37.81 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>