More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6075 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  100 
 
 		 319 aa  623  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  67.31 
 
 		 314 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  67.63 
 
 		 314 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  67.74 
 
 		 314 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  67.52 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3343  nickel transporter permease NikB  67.1 
 
 		 313 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3006  nickel transporter permease NikB  67.42 
 
 		 313 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0438476  normal  0.3014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  62.21 
 
 		 314 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  61.89 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  61.89 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  61.89 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  61.89 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  61.89 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  61.89 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  61.89 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  61.89 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1835  nickel transporter permease NikB  61.56 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  hitchhiker  0.0019148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2401  nickel transporter permease NikB  64.44 
 
 		 313 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  51.13 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1322  nickel transport system permease protein NikB  52.43 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.63 
 
 		 312 aa  332  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.35 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  39.94 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.19 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.45 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  39.7 
 
 		 335 aa  242  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  39.76 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  42.09 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  40.19 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  40.77 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  39.23 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  39.7 
 
 		 335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 		 306 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 		 335 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 		 316 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  39.74 
 
 		 316 aa  228  7e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 319 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.93 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  37.3 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  39.1 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.56 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.56 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.56 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.56 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  41.56 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.51 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.51 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.9 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  40.6 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  40.6 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.76 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  38.69 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  40.6 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.56 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  39.1 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  40.6 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  37.31 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  41.88 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  36.36 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  41.56 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  41.56 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  41.88 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>