More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1322 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1322  nickel transport system permease protein NikB  100 
 
 		 310 aa  617  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00196564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  54.69 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  53.07 
 
 		 314 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  52.1 
 
 		 314 aa  348  6e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  52.1 
 
 		 314 aa  348  9e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  52.43 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  51.47 
 
 		 314 aa  325  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  51.47 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  51.47 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  51.47 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  51.47 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  51.47 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  51.47 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  51.47 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  51.47 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3006  nickel transporter permease NikB  50.97 
 
 		 313 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0438476  normal  0.3014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3343  nickel transporter permease NikB  50 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1835  nickel transporter permease NikB  51.14 
 
 		 314 aa  305  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  hitchhiker  0.0019148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2401  nickel transporter permease NikB  50.81 
 
 		 313 aa  298  5e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  44.98 
 
 		 310 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 		 312 aa  281  9e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  40.58 
 
 		 311 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30112  hitchhiker  0.0000547502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  34.84 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2371  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.26 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  34.63 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.69 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1517  peptide ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0892192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.184188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  35.96 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 		 340 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  35.33 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  35.99 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  35.65 
 
 		 316 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.65 
 
 		 316 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  33.13 
 
 		 336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  normal  0.480947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.39 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  32.84 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00533013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  33.73 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.85 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  32.54 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 		 326 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  33.73 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.83 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  32.54 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.84 
 
 		 337 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  33.66 
 
 		 307 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>