More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2616 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
324 aa  636    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.71 
 
 
323 aa  557  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.4 
 
 
325 aa  497  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.4 
 
 
325 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.42 
 
 
325 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.18 
 
 
324 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  61.25 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.21 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.8 
 
 
325 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.94 
 
 
324 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 
327 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 
327 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.31 
 
 
323 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740453  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1882  peptide ABC transporter transmembrane protein  59.13 
 
 
328 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0184491  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.88 
 
 
315 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.39 
 
 
324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00239771  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2810  peptide ABC transporter, permease protein  57.78 
 
 
324 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2538  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.46 
 
 
324 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000540331  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1241  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.74 
 
 
323 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.16 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.5 
 
 
328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  49.22 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
327 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
327 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.93 
 
 
326 aa  301  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2856  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  48.28 
 
 
326 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7193  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  46.88 
 
 
326 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 
326 aa  298  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.31 
 
 
326 aa  297  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 
325 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.642958  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 
324 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.16 
 
 
321 aa  291  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 
326 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
326 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508516  normal  0.0813716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.68 
 
 
326 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.93 
 
 
326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.365334  normal  0.156098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  42.77 
 
 
391 aa  278  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00494  ABC transporter permease component  40.37 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  42.94 
 
 
336 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  44.01 
 
 
337 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2565  peptide ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
342 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.304242  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
325 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  42.34 
 
 
336 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0096  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  38.51 
 
 
325 aa  265  8e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
324 aa  262  6e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000247365  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001973  peptide ABC transporter permease component  40.98 
 
 
310 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0563  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  39.44 
 
 
325 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
325 aa  255  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.34 
 
 
336 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  40.54 
 
 
336 aa  255  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 
335 aa  255  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  42.04 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  41.67 
 
 
351 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  41.37 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  41.44 
 
 
336 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 
324 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.57 
 
 
349 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00059192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 
339 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  41.07 
 
 
339 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  41.07 
 
 
339 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  41.74 
 
 
336 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 
336 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 
336 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  42.04 
 
 
336 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
306 aa  249  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 
349 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
322 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.000255832  decreased coverage  0.000142665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  41.44 
 
 
336 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
334 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
336 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
334 aa  245  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  40.77 
 
 
339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  40.77 
 
 
339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  42.64 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 
338 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 
338 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  38.87 
 
 
339 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
334 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.49 
 
 
338 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.49 
 
 
338 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  39.76 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  40.06 
 
 
339 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  42.34 
 
 
336 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  42.34 
 
 
336 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  42.34 
 
 
336 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  38.99 
 
 
339 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  38.99 
 
 
339 aa  238  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  38.99 
 
 
339 aa  238  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  38.99 
 
 
339 aa  238  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  38.99 
 
 
339 aa  238  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>