More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4475 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
326 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.01 
 
 
326 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2856  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  78.53 
 
 
326 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.52 
 
 
327 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.31 
 
 
326 aa  428  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.88 
 
 
328 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.19 
 
 
327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.82 
 
 
321 aa  404  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  64.89 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.19 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7193  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  59.06 
 
 
326 aa  394  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.52 
 
 
326 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508516  normal  0.0813716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.66 
 
 
326 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.5 
 
 
326 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.96 
 
 
326 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.01 
 
 
338 aa  374  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.365334  normal  0.156098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.81 
 
 
321 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.29 
 
 
322 aa  349  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.000255832  decreased coverage  0.000142665 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00494  ABC transporter permease component  45.4 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  49.69 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2565  peptide ABC transporter, permease protein  46.32 
 
 
342 aa  322  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.304242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0563  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  47.24 
 
 
325 aa  322  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
326 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0096  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  43.87 
 
 
325 aa  315  5e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001973  peptide ABC transporter permease component  45.63 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 
349 aa  312  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00059192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
325 aa  311  9e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 
325 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.27 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.68 
 
 
324 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000247365  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 
324 aa  285  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 
327 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.26 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
324 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.25 
 
 
325 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
324 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  43.38 
 
 
325 aa  275  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 
325 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
325 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1882  peptide ABC transporter transmembrane protein  42.02 
 
 
328 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0184491  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
325 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.03 
 
 
323 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740453  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
315 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  41.79 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 
334 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  40 
 
 
307 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2538  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.81 
 
 
324 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000540331  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2810  peptide ABC transporter, permease protein  39.51 
 
 
324 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
307 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
306 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
307 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  39.88 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  40.37 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1241  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.55 
 
 
323 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
311 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
305 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
304 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
306 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
306 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
312 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
324 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00239771  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
334 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
335 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
306 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
309 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 
333 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  38.75 
 
 
306 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
324 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 
306 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  40.65 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.642958  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  40.54 
 
 
336 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  40.54 
 
 
336 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.38 
 
 
306 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  38.92 
 
 
337 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
336 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
336 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.75 
 
 
306 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  40.24 
 
 
336 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  38.44 
 
 
306 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
313 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  40.36 
 
 
339 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.75 
 
 
306 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  40.24 
 
 
336 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
304 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.81 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.81 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.81 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.81 
 
 
306 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
335 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
306 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
336 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.81 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  40.53 
 
 
339 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>