More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0226 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  342  2e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  87.86 
 
 		 173 aa  308  2.9999999999999997e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  60.95 
 
 		 176 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  57.23 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  58.58 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  60 
 
 		 175 aa  184  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  55.62 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  58.72 
 
 		 175 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  59.76 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  52.91 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  55.29 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  61.05 
 
 		 212 aa  179  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  53.76 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  52.94 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  55.81 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  57.23 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  58.33 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  58.38 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  53.85 
 
 		 190 aa  174  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  54.39 
 
 		 174 aa  174  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  53.49 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  52.3 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 228 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  55.97 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  51.18 
 
 		 203 aa  168  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  50.3 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  52.07 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  52.07 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  50.3 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  50.3 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  50.3 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  50.3 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  50.89 
 
 		 179 aa  150  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  47.34 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  49.11 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  52.23 
 
 		 197 aa  147  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  44.05 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  45.86 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  42.41 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  38.15 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  41.62 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  35.2 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 175 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  36.69 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  35.84 
 
 		 172 aa  98.2  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  38.61 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  33.53 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  40.25 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 205 aa  95.5  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  41.29 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  38.61 
 
 		 177 aa  94.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  38.35 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  38.36 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  36 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  34.59 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  36.77 
 
 		 256 aa  92.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  38.06 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>