214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3428 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 
223 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  49.7 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  46.67 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  43.93 
 
 
275 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  40.43 
 
 
274 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  42.47 
 
 
261 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  40.91 
 
 
186 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  46.51 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  45.11 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  40.91 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  45.22 
 
 
186 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  48.87 
 
 
242 aa  91.3  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  46.41 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  43.26 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  41.1 
 
 
262 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  34.71 
 
 
250 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  50.41 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  29.51 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  33.15 
 
 
303 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  39.88 
 
 
288 aa  78.2  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  32.37 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  32.37 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  38.89 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  32.37 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  40.26 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  31.98 
 
 
304 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  41.57 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.77 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  42.92 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.8 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  35.33 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  45.39 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.1 
 
 
308 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  45.7 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  32.26 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  37.97 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  33.33 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  37.24 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  34.12 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  47.58 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  32.43 
 
 
308 aa  72  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  35.05 
 
 
288 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  27.84 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  35.19 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.73 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  41.67 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  30.57 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  35.84 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.79 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  28.26 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  29.17 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.98 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  44.51 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  36.22 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  36.26 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  31.89 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  33.72 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  34.88 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  37.72 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  23.39 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.53 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  40 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.37 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  33.53 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  32.24 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  34.22 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  29.76 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3440  prepilin peptidase  31.89 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.823823  normal  0.0376305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  31.74 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.96 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.84 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  28.57 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  25.77 
 
 
274 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  29.95 
 
 
287 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.98 
 
 
309 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  31.96 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  33.73 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.26 
 
 
285 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  38.06 
 
 
155 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  31.61 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  32.32 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  30.82 
 
 
286 aa  62.4  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  32.8 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  38.16 
 
 
155 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  30.54 
 
 
289 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  29.65 
 
 
301 aa  62  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.64 
 
 
283 aa  62  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  34.25 
 
 
280 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  30.82 
 
 
286 aa  62  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  36.57 
 
 
293 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.57 
 
 
293 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  39.77 
 
 
303 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  37.5 
 
 
155 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  30.59 
 
 
246 aa  61.6  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  32.37 
 
 
255 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  30 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  36.87 
 
 
303 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  32.16 
 
 
291 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.93 
 
 
287 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  33.52 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>