More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1014 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1014  UspA domain protein  100 
 
 		 166 aa  319  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  48.57 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 		 293 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.31 
 
 		 288 aa  84.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  39.58 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  42.25 
 
 		 339 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  41.01 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  40.69 
 
 		 288 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  42.86 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 289 aa  74.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 293 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  37.23 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.36 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  40.27 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 292 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  39.86 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.12 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  40 
 
 		 321 aa  67.8  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  38.76 
 
 		 307 aa  67.4  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  36.3 
 
 		 306 aa  67.4  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  39.46 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  36.36 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  34.23 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.56 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  36.91 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  36.62 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  38.19 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.69 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  38.19 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 289 aa  64.3  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 296 aa  63.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05020  universal stress protein UspA-like protein  41.06 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  32.87 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  38.19 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.86 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  34.69 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  39.01 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  35.81 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.06 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0949  UspA domain protein  40.28 
 
 		 331 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132652  normal  0.0181278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  36.05 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  36.62 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 293 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.66 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 293 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  37.24 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  40.56 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  37.93 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  42.18 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.73 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  34.78 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.73 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  32.67 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.25 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1833  UspA domain protein  38.89 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0847869  normal  0.369126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  28.93 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  37.33 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  37.41 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>