More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1833 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1833  UspA domain protein  100 
 
 		 342 aa  641    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0847869  normal  0.369126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  50 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  42.11 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  39.72 
 
 		 301 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.72 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38.54 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  38.62 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  41.92 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.52 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.07 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.35 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.16 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 		 289 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  36.46 
 
 		 287 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.67 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  37.46 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.67 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.8 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  37.05 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  36.91 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  35.16 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.01 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  37.71 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  38.31 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.53 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  32.88 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.47 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  35.54 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  35.34 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  35.4 
 
 		 290 aa  99.4  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  36.27 
 
 		 300 aa  99.4  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30.98 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 277 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35.69 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  34.35 
 
 		 282 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.29 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.96 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 291 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  31.83 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  37.62 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  34.64 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  37.87 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 296 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  36.07 
 
 		 229 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  34.59 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  36.01 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  34.34 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.06 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  31.96 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  34.35 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  32.89 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  30.35 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35.92 
 
 		 285 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  32.99 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  35.03 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  33.89 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  32.87 
 
 		 287 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  32.78 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2049  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 		 295 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  33.11 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  31.38 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  34.25 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  33.1 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  33.62 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.68 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  32.9 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  34.01 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  32.32 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  35.15 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  32.42 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  32.89 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 148 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  31 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>