More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0937 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 269 aa  521  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  70.26 
 
 		 269 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  62.17 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  66.54 
 
 		 267 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  61.71 
 
 		 266 aa  333  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  59.54 
 
 		 265 aa  300  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  58.74 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  53.41 
 
 		 266 aa  278  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  54.28 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  53.58 
 
 		 285 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  52.4 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  49.24 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  48.31 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  49.03 
 
 		 282 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  49.03 
 
 		 282 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  49.03 
 
 		 282 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  46.69 
 
 		 284 aa  234  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  47.31 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  46.82 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  46.3 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  46.82 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  44.11 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.52 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  44.49 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  46.3 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  39.55 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  48.02 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  40.67 
 
 		 272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  40.46 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  40.56 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  40.31 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  38.26 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  39 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  38.91 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  40.46 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  40.47 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  39.76 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  38.64 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  40.38 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 		 278 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  38.31 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  40.68 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  39.77 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  37.31 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  37.98 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  37.12 
 
 		 269 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  40.46 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  36.68 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  40.64 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.98 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  35.77 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  34.33 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  36.19 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  38 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  34.24 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  40.74 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.61 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  38.64 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  32.17 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.03 
 
 		 257 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 270 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  36.94 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  33.84 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  34.36 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  33.92 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  33.92 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  33.92 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  33.04 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  33.48 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  33.61 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  34.36 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>