More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0223 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0223  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0010  two component LuxR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4654  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4742  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0835551  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5037  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  32.7 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  32.7 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  32.7 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  32.7 
 
 		 215 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  32.7 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  32.7 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  32.7 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  32.7 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  32.7 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  34.31 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  34.31 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.8 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  34.15 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  101  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.64 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.18 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  33.79 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  32.7 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 208 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  36.02 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  33.82 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  34.3 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  34.3 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  34.3 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  34.3 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  34.3 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  32.51 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  37.68 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  34.3 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  34.3 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.94 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  34.3 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.56 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  32.02 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>