More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2864 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  256  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  71.31 
 
 		 128 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  67.23 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  63.03 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  62.18 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  61.98 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  59.17 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  47.46 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  48.67 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  51.09 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  51.09 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  43.86 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  48.72 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  45.83 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  44.17 
 
 		 167 aa  97.4  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  47.86 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  47.41 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  46.49 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  46.02 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  43.8 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  42.59 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  46.32 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  44.35 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  45.19 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  46.32 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  40.35 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  41.18 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  38.94 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  45.54 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  43.24 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  43.27 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  43.24 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  43.24 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  43.1 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  41.74 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  43.24 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  38.98 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  41.94 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  41.74 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  42.74 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  43.86 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  44.35 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  40.34 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  46.67 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  40.5 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  39.34 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  42.15 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  38.52 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  41.53 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  44.07 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  42.59 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  36.67 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  39.82 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  41.23 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  37.93 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  45.22 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  42.16 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  43.69 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  41.59 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2655  hypothetical protein  43.24 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  42.37 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  39.82 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  42.37 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  38.18 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  44.86 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  41.18 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  39.52 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  39.83 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  38.98 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  40.91 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  36.94 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  37.29 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  38.1 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  41.59 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  37.14 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  36.21 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.36 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  41.53 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  41.53 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  41.53 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  41.53 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  41.53 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  35.59 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  36.97 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  36.97 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  38.18 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.66 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>