More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0972 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0972  type II secretion system protein E  100 
 
 		 528 aa  1090    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2855  type II secretion system protein E  38.54 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.370108  normal  0.352738 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2860  type II secretion system protein E  37.12 
 
 		 491 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.898794  normal  0.474728 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  34.85 
 
 		 553 aa  299  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  34.51 
 
 		 564 aa  296  8e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 561 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  32.85 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  35.28 
 
 		 594 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.89 
 
 		 571 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  35.44 
 
 		 556 aa  289  9e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  35.83 
 
 		 553 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  37.62 
 
 		 559 aa  287  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  34.13 
 
 		 637 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  33.59 
 
 		 589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  34.95 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  33.94 
 
 		 577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  33.4 
 
 		 585 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  35.59 
 
 		 557 aa  281  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  33.86 
 
 		 575 aa  280  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  34.3 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  34.71 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  33.92 
 
 		 574 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  33.85 
 
 		 570 aa  277  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  33.86 
 
 		 555 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  35.53 
 
 		 560 aa  276  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  35.04 
 
 		 574 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  34.24 
 
 		 554 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  33.91 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.33 
 
 		 568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  32.14 
 
 		 612 aa  274  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  34.16 
 
 		 574 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  34.64 
 
 		 554 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 553 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  42.64 
 
 		 417 aa  273  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  32.55 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.13 
 
 		 568 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.95 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  33.02 
 
 		 585 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  41.48 
 
 		 563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  46.53 
 
 		 463 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  46.05 
 
 		 469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  41.95 
 
 		 520 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  42.64 
 
 		 871 aa  270  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  33.92 
 
 		 587 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  32.86 
 
 		 558 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.72 
 
 		 568 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2780  type II secretion system protein E  43.42 
 
 		 548 aa  270  7e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  33.59 
 
 		 599 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  33.4 
 
 		 599 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  36.55 
 
 		 521 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  34.79 
 
 		 561 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1755  general secretory pathway protein E  45.54 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571927  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  33.2 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.52 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  34.26 
 
 		 561 aa  267  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  39.21 
 
 		 577 aa  267  4e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  32.8 
 
 		 568 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  33.07 
 
 		 578 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 568 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  33.14 
 
 		 571 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  39.04 
 
 		 493 aa  266  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 561 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  32.68 
 
 		 558 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  33.27 
 
 		 584 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  39.04 
 
 		 493 aa  266  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  39.04 
 
 		 493 aa  266  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  32.95 
 
 		 582 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0645  general secretory pathway protein E  46.2 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0666  general secretory pathway protein E  46.2 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.726571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  39.04 
 
 		 493 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  41.85 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  39.04 
 
 		 493 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  30.78 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  39.64 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  33.4 
 
 		 586 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  41.98 
 
 		 514 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  34.12 
 
 		 568 aa  264  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.94 
 
 		 568 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.94 
 
 		 568 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  32.48 
 
 		 578 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  38.71 
 
 		 482 aa  263  6e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  33.16 
 
 		 572 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.9 
 
 		 520 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  32.94 
 
 		 568 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  40.43 
 
 		 520 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  41.39 
 
 		 503 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  32.38 
 
 		 569 aa  263  8e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.93 
 
 		 568 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  39.94 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  32.87 
 
 		 566 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  33.01 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.4 
 
 		 568 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  32.56 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0543  type II secretion system protein E  44.74 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  33.01 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  33.01 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  31.76 
 
 		 891 aa  261  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  42.55 
 
 		 514 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>