294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1316 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
198 aa  387  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  50.56 
 
 
197 aa  170  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.48 
 
 
186 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  40.45 
 
 
194 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.04 
 
 
190 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  39.66 
 
 
217 aa  121  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.11 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.11 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.99 
 
 
186 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.71 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  35.96 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.16 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
186 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.16 
 
 
186 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.88 
 
 
186 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.88 
 
 
193 aa  104  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.93 
 
 
184 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
180 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
186 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  32.96 
 
 
186 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
186 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  35.2 
 
 
186 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  36.47 
 
 
196 aa  97.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  35.45 
 
 
211 aa  94.4  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  34.66 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  32.4 
 
 
186 aa  91.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  32.78 
 
 
190 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  32.4 
 
 
186 aa  91.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  34.29 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  34.66 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 
179 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  32.4 
 
 
186 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  30.73 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  29.61 
 
 
179 aa  84.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  30.56 
 
 
188 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.8 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  30.41 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.12 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  34.48 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0190  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.39 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459232 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  28.02 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.11 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2027  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.39 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.0511628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2330  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.39 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00362801  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  34.52 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  28.89 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  26.67 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  25.45 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.28 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.66 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.97 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
177 aa  62.4  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03280  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 
178 aa  62  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  34.45 
 
 
178 aa  61.6  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.56 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.66 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  24.42 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.04 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.54 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  27.49 
 
 
218 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.02 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  28.74 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.42 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  24.58 
 
 
183 aa  60.5  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>