230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2406 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 325 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  61.37 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  58.57 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  61.06 
 
 		 335 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  61.06 
 
 		 335 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  61.06 
 
 		 335 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  57.23 
 
 		 335 aa  364  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  58.88 
 
 		 326 aa  355  7.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  57.32 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  53.89 
 
 		 321 aa  329  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  48.46 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  41.85 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  40.5 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  42.9 
 
 		 319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  41.67 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  42.58 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  38.82 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  46.11 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  44.29 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  44.41 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  43.4 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  40.14 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  44.29 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  41.75 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  41.3 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  32.35 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  34.32 
 
 		 353 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  34.06 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 		 350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  32.87 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  32.2 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  33 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  39.83 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.07 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  29.25 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  32.29 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.87 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  28.94 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  25.82 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  29.14 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  28.66 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  27.88 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  28.28 
 
 		 359 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  29.41 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.73 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  27.36 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  29.15 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  22.01 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  30.71 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.18 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  28.91 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  21.84 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.49 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  29.43 
 
 		 544 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  33.16 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  27.38 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  26.32 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  27.3 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.76 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  26.62 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 		 1100 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  27.8 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  25.34 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  29.24 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  27.61 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  25.66 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  24.29 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  29.44 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 644 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  26.72 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  24.84 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  27.67 
 
 		 892 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  27.9 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>