233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2194 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
350 aa  704    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  71.69 
 
 
332 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  58.36 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  60.06 
 
 
333 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  59.82 
 
 
398 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  57.4 
 
 
333 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  58.36 
 
 
400 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  59.82 
 
 
399 aa  391  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  56.94 
 
 
399 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  56.94 
 
 
399 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  56.94 
 
 
399 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  58.98 
 
 
330 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  63.38 
 
 
329 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  58.15 
 
 
330 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  56.94 
 
 
346 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  56.94 
 
 
346 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  56.94 
 
 
346 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  57.1 
 
 
341 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  57.18 
 
 
348 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  58.88 
 
 
352 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  52.63 
 
 
399 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  56.05 
 
 
352 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  53.53 
 
 
342 aa  363  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  59.01 
 
 
330 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  56.79 
 
 
332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  57.1 
 
 
332 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  55.78 
 
 
360 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  55.52 
 
 
419 aa  351  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  52.8 
 
 
362 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  57.46 
 
 
342 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  54.98 
 
 
328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  60.86 
 
 
474 aa  341  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  51.91 
 
 
367 aa  338  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  53.78 
 
 
337 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  54.88 
 
 
328 aa  333  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  54.13 
 
 
369 aa  331  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  48.75 
 
 
343 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  53.42 
 
 
328 aa  322  6e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  51.49 
 
 
397 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  51.46 
 
 
330 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  50.87 
 
 
334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  51.28 
 
 
338 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  51.15 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  50.32 
 
 
336 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  52.24 
 
 
324 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  51.59 
 
 
337 aa  291  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  51.15 
 
 
337 aa  288  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  51.25 
 
 
337 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  44.8 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  44.71 
 
 
337 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  43.54 
 
 
322 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  43.54 
 
 
322 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  43.54 
 
 
322 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  41.4 
 
 
344 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.27 
 
 
325 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  39.6 
 
 
360 aa  252  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  40.17 
 
 
344 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  40.23 
 
 
339 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  44.61 
 
 
346 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  40.25 
 
 
321 aa  246  4e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  39.27 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  48.09 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  41.32 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  40.73 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  39.42 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  38.18 
 
 
334 aa  241  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  40.84 
 
 
314 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.56 
 
 
306 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  40.84 
 
 
314 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  41.01 
 
 
321 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  39.42 
 
 
329 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  41.27 
 
 
308 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  40.18 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  43.33 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  42.42 
 
 
334 aa  232  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  44.33 
 
 
314 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  41.1 
 
 
312 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  41.25 
 
 
352 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  37.95 
 
 
320 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  45.4 
 
 
346 aa  225  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  37.9 
 
 
342 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  40.38 
 
 
343 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  41.04 
 
 
313 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  37.03 
 
 
328 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  42.12 
 
 
328 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  52.27 
 
 
310 aa  224  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  42.49 
 
 
328 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  37.31 
 
 
311 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  36.84 
 
 
354 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  36.22 
 
 
354 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  35.1 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  42.86 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  37.18 
 
 
338 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  39.17 
 
 
330 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  40 
 
 
321 aa  219  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  38.67 
 
 
318 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  36 
 
 
330 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  35.96 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  35.98 
 
 
347 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  36.02 
 
 
354 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>