More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3500 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  100 
 
 		 448 aa  917    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  94.25 
 
 		 448 aa  853    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  58.06 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  45.39 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  43.32 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  44.2 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  43.62 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  43.66 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  42.38 
 
 		 448 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  40.23 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  37.95 
 
 		 453 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  30.28 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  31.23 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  32.3 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  33.04 
 
 		 456 aa  206  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  33.17 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  31.27 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  32.1 
 
 		 457 aa  196  9e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  31.45 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  34.09 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  30.8 
 
 		 459 aa  193  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  31.42 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  29.5 
 
 		 306 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  34.74 
 
 		 294 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  34.07 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  28.88 
 
 		 273 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  48.98 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  28.11 
 
 		 266 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  48.04 
 
 		 309 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  27.71 
 
 		 244 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.47 
 
 		 301 aa  97.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.64 
 
 		 285 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  46.39 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  31.86 
 
 		 268 aa  95.5  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  49.47 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  29.65 
 
 		 269 aa  94.4  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  48.45 
 
 		 379 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  27.17 
 
 		 285 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  47.92 
 
 		 303 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.86 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  41.35 
 
 		 285 aa  90.5  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.87 
 
 		 238 aa  90.1  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  26.82 
 
 		 286 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  30.45 
 
 		 374 aa  89.7  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  31.15 
 
 		 283 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  45.36 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  48.98 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  44.44 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  44.44 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  46.39 
 
 		 541 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  44.33 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  42.86 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  45.26 
 
 		 229 aa  87.4  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  43.88 
 
 		 377 aa  87.4  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  42.27 
 
 		 373 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  42.27 
 
 		 301 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  33.13 
 
 		 331 aa  86.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  45.36 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  37.31 
 
 		 314 aa  86.3  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  30.3 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  44 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.36 
 
 		 328 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  47.42 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  44.68 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  30.3 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  41.84 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  43.3 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.74 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  46.39 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  40.82 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  44.33 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  34.23 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  43.62 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.3 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  25.79 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  42.16 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  31.82 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  38.61 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  45 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  42.27 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  36.72 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  46.43 
 
 		 687 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  40.62 
 
 		 599 aa  83.2  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  34.62 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  39.8 
 
 		 274 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  45.74 
 
 		 230 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  39.62 
 
 		 454 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  43.82 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  44.68 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  43.88 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  38.32 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  37.21 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  29.77 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  42.55 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  43.62 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  44.68 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  42.27 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>