More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3306 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 249 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  91.53 
 
 		 249 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  54.22 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  41.04 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  36.25 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  34.66 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  39.04 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  35.22 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  33.2 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  29.64 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  28.92 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  31.75 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  31.75 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  31.35 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  30.35 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  25.76 
 
 		 311 aa  88.6  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  27.56 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  30.71 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  27.13 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  24.51 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  28.51 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  30.2 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  28.23 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  27.39 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  27.31 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  26.51 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  26.51 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  26.51 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  38.94 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  30.08 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  30.89 
 
 		 356 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  36.46 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  33.65 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  36.45 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  35.82 
 
 		 407 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.03 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  39.8 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  30.77 
 
 		 400 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  33.98 
 
 		 185 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  30.56 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  32.98 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.35 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  29.46 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  29.46 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  29.46 
 
 		 315 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  30.28 
 
 		 653 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.42 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.86 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 400 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.64 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.36 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.07 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  30.71 
 
 		 315 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.48 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 400 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.86 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.13 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  52  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 		 230 aa  52  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  52  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 365 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  30.23 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  31.98 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  35 
 
 		 341 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  34.51 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  24.28 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.73 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>