More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1379 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_18201  transketolase  50.66 
 
 		 668 aa  706    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  49.48 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  50.15 
 
 		 663 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  49.48 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  54.81 
 
 		 666 aa  761    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  54.81 
 
 		 666 aa  761    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  52.44 
 
 		 669 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  49.85 
 
 		 664 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  50.3 
 
 		 662 aa  685    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.74 
 
 		 670 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  50.74 
 
 		 670 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  49.34 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  51.86 
 
 		 664 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  54.46 
 
 		 666 aa  770    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  659    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  52.5 
 
 		 661 aa  676    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  49.64 
 
 		 712 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  53.95 
 
 		 671 aa  742    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  50.66 
 
 		 674 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  54.61 
 
 		 666 aa  767    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  51.56 
 
 		 664 aa  687    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  54.76 
 
 		 666 aa  770    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  51.27 
 
 		 664 aa  685    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  54.61 
 
 		 666 aa  766    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  66.62 
 
 		 691 aa  905    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  48.81 
 
 		 664 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  47.9 
 
 		 679 aa  648    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  50 
 
 		 663 aa  659    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  50.15 
 
 		 662 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  50.14 
 
 		 694 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  50.07 
 
 		 707 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  51.93 
 
 		 670 aa  715    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  49.48 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  53.01 
 
 		 669 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.07 
 
 		 670 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1034  transketolase  51.26 
 
 		 666 aa  638    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  49.41 
 
 		 694 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  50.07 
 
 		 666 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  54.32 
 
 		 664 aa  684    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  60.56 
 
 		 674 aa  787    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  53.46 
 
 		 684 aa  704    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  53.44 
 
 		 669 aa  712    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  53.29 
 
 		 669 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.92 
 
 		 670 aa  731    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  49.34 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  50.66 
 
 		 674 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  54.61 
 
 		 666 aa  767    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.51 
 
 		 668 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  54.6 
 
 		 668 aa  740    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  50.07 
 
 		 666 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  52.61 
 
 		 707 aa  704    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  66.91 
 
 		 688 aa  921    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  52.95 
 
 		 698 aa  714    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  51.4 
 
 		 691 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  55.06 
 
 		 666 aa  767    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  49.48 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  52.7 
 
 		 691 aa  689    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  54.15 
 
 		 666 aa  759    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  51.25 
 
 		 691 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  55.59 
 
 		 686 aa  714    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  50.43 
 
 		 694 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  51.84 
 
 		 695 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  49.85 
 
 		 664 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  50.07 
 
 		 666 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  54.41 
 
 		 666 aa  760    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  51.56 
 
 		 663 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  49.34 
 
 		 680 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  52.37 
 
 		 670 aa  717    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  48.14 
 
 		 665 aa  637    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  53.06 
 
 		 697 aa  727    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  54.25 
 
 		 667 aa  678    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  49.26 
 
 		 662 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  67.9 
 
 		 691 aa  933    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  57 
 
 		 667 aa  776    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  48.82 
 
 		 662 aa  648    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  52.77 
 
 		 672 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  52.65 
 
 		 668 aa  731    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  53.68 
 
 		 668 aa  738    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  49.26 
 
 		 663 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  50.15 
 
 		 662 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0910  transketolase  50.96 
 
 		 686 aa  639    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  64.71 
 
 		 695 aa  889    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  49.85 
 
 		 665 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  51.76 
 
 		 658 aa  658    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50.51 
 
 		 668 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  49.93 
 
 		 666 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  100 
 
 		 711 aa  1424    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  67.9 
 
 		 691 aa  933    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  53.44 
 
 		 655 aa  671    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  50.52 
 
 		 692 aa  655    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  55.19 
 
 		 671 aa  730    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  50.95 
 
 		 668 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  49.7 
 
 		 664 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  657    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>