More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3527 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  58.57 
 
 
508 aa  655    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  59.56 
 
 
508 aa  659    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  59.36 
 
 
508 aa  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  58.96 
 
 
508 aa  651    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  59.16 
 
 
508 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
508 aa  1061    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  59.36 
 
 
508 aa  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  57.77 
 
 
508 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  59.36 
 
 
508 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  58.96 
 
 
508 aa  651    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  61.88 
 
 
508 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  79.32 
 
 
507 aa  847    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  57.97 
 
 
508 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  55.31 
 
 
525 aa  591  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  55.11 
 
 
525 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  49.9 
 
 
520 aa  534  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  50.81 
 
 
521 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  48.99 
 
 
521 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  45.56 
 
 
513 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  44.2 
 
 
513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  44.31 
 
 
510 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 
524 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.29 
 
 
479 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 
604 aa  349  6e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 
512 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 
482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  40.2 
 
 
504 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 
516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
592 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
508 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 
531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  35.03 
 
 
517 aa  270  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  37.43 
 
 
394 aa  269  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
514 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
506 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
499 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
435 aa  257  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
513 aa  253  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  31.42 
 
 
507 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
526 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
506 aa  250  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  31.29 
 
 
504 aa  243  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
501 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
502 aa  236  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
510 aa  236  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
513 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 
499 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
504 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
504 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
518 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
507 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
503 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
388 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.18 
 
 
227 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
424 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  25.43 
 
 
431 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
428 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 
431 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
433 aa  99.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
431 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 
425 aa  97.8  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  25.43 
 
 
438 aa  97.8  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
437 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  26.37 
 
 
468 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  26.37 
 
 
468 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 
437 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
430 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  26.37 
 
 
468 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  24.49 
 
 
439 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 
427 aa  94  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
433 aa  94  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 
433 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
443 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  23.85 
 
 
439 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 
436 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
426 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  27.09 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  26.11 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  27.59 
 
 
397 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 
429 aa  91.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  21.83 
 
 
397 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 
429 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
434 aa  91.3  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  22.76 
 
 
429 aa  90.9  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
397 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  22.78 
 
 
435 aa  90.5  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
411 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  23.69 
 
 
405 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 
401 aa  90.5  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 
429 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 
429 aa  90.1  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
432 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  24.71 
 
 
435 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3974  hypothetical protein  22.08 
 
 
397 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  23.25 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  23.44 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>