More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3398 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3398  Peptidase M23  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3286  Peptidase M23  64.19 
 
 
302 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3801  peptidase M23B  47.06 
 
 
309 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.769229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5131  stage II sporulation protein  47.1 
 
 
301 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5524  stage II sporulation protein  47.1 
 
 
301 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5403  stage II sporulation protein  48.08 
 
 
301 aa  235  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000422093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5407  stage II sporulation protein  48.46 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.388576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4964  stage II sporulation protein Q  53.18 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000820268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4982  stage II sporulation protein Q  53.18 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5080  peptidase M23B  45.39 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5373  stage II sporulation protein  53.18 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0925388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5458  stage II sporulation protein  48.46 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000429439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5547  stage II sporulation protein  47.06 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00247023  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2751  Peptidase M23  29.33 
 
 
225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0548  peptidase M23B  38.22 
 
 
244 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00447609  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  39.05 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.05 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  33.57 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  39.42 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  38.24 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  37.25 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  38.24 
 
 
450 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  37 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  32.11 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  33.64 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  36.27 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  36.27 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  35.78 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  33.94 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  38.18 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3330  Peptidase M23  39.22 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0172603  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  37.74 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  34.55 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  37.08 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  34.29 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  34.31 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  29.66 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  35.34 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  36.27 
 
 
491 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.58 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  35.29 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  37.62 
 
 
423 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1795  Peptidase M23  40.54 
 
 
327 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  35 
 
 
238 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  34.29 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  31.21 
 
 
546 aa  66.2  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  37.5 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  37.93 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  43.66 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  43.66 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  36.27 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  33.05 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  30.83 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  35.78 
 
 
433 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  29.32 
 
 
392 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  36.19 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  30 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  38.2 
 
 
367 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  35.24 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  39.42 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  34.62 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  34.91 
 
 
469 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  39.22 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  30.08 
 
 
391 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  35.63 
 
 
455 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  35.24 
 
 
369 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  35.29 
 
 
402 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  36.45 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  34.62 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  34.86 
 
 
541 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  30.77 
 
 
412 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  32.09 
 
 
440 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  32.09 
 
 
440 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  32.09 
 
 
440 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  32.09 
 
 
440 aa  63.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  32.09 
 
 
440 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  32.09 
 
 
440 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  32.09 
 
 
440 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  32.09 
 
 
440 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  32.35 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  32.09 
 
 
419 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  38.61 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17750  peptidase M23B  34.82 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  31.53 
 
 
527 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  38.83 
 
 
333 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  37 
 
 
400 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  32.99 
 
 
363 aa  62.4  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 
347 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  37.5 
 
 
431 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  35 
 
 
453 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  36.27 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  34.26 
 
 
539 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1772  M23/M37 familypeptidase  34.59 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  32.69 
 
 
430 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4343  Peptidase M23  31.14 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  34.09 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  32.73 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  37.62 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  35.92 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.35 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>