More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1383 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1383  exonuclease  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  54.72 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  51.25 
 
 		 168 aa  167  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1420  DNA-directed DNA polymerase  50.63 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2155  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2007  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.98 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6094  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.98 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0666129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1983  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.98 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5296  DNA-directed DNA polymerase  40.74 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0646344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.21 
 
 		 218 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.18 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.4 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5458  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.51 
 
 		 205 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4910  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.51 
 
 		 205 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0387516  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.07 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.04 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  41.03 
 
 		 1442 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.4 
 
 		 208 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4300  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.65 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0011109  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0049  DNA-directed DNA polymerase  44.94 
 
 		 208 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00111641  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  39.64 
 
 		 1433 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.76 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  40.76 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.04 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2251  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.76 
 
 		 229 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4665  exonuclease, putative  37.04 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.356009  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1834  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.74 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.600995  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0097  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.86 
 
 		 211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3773  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.76 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1770  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.76 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.76 
 
 		 239 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4924  exonuclease  37.2 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4061  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.49 
 
 		 204 aa  110  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.22 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  39.49 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  40.51 
 
 		 1426 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.58 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  36.31 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4768  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.63 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.392412  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.31 
 
 		 565 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2114  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.85 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  36.31 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  37.42 
 
 		 1449 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  37.42 
 
 		 1449 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2125  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.03 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2355  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.85 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2460  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.85 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.13 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2344  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.85 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0016  DNA-directed DNA polymerase  41.5 
 
 		 221 aa  104  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.85 
 
 		 208 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187406  hitchhiker  0.0000370659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4643  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.41 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  41.77 
 
 		 1367 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  41.77 
 
 		 1367 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  33.97 
 
 		 1407 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4781  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.41 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  40.25 
 
 		 584 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.72 
 
 		 595 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  36.94 
 
 		 1397 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.77 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0016  DNA-directed DNA polymerase  39.46 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4160  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.46 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  37.18 
 
 		 1365 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  41.67 
 
 		 1435 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.15 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  40.91 
 
 		 1433 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 208 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  40.91 
 
 		 1433 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  36.69 
 
 		 1390 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.25 
 
 		 610 aa  99.4  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  35.03 
 
 		 203 aa  98.6  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  39.61 
 
 		 970 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.27 
 
 		 502 aa  98.2  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  39.61 
 
 		 1433 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  39.61 
 
 		 1433 aa  97.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  39.61 
 
 		 1433 aa  97.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  39.61 
 
 		 1433 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0827  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.12 
 
 		 470 aa  97.8  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  39.61 
 
 		 1433 aa  97.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  39.61 
 
 		 1433 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  41.51 
 
 		 570 aa  97.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  39.61 
 
 		 1433 aa  97.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  34.73 
 
 		 315 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2197  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.31 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519695  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  35.67 
 
 		 1402 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  35.15 
 
 		 315 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  33.52 
 
 		 299 aa  97.1  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  34.73 
 
 		 315 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  34.73 
 
 		 315 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.38 
 
 		 921 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  38.99 
 
 		 551 aa  96.3  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.11 
 
 		 481 aa  96.3  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  34.73 
 
 		 315 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  38.75 
 
 		 1433 aa  95.9  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  35.37 
 
 		 315 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  34.94 
 
 		 315 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  38.24 
 
 		 230 aa  95.5  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.62 
 
 		 715 aa  95.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  34.73 
 
 		 315 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>