More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0773 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  100 
 
 		 399 aa  772    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  88.75 
 
 		 396 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  58.21 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 407 aa  349  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  48.21 
 
 		 406 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  26.86 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.27 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.12 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.12 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.85 
 
 		 381 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.85 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.85 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.39 
 
 		 381 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.56 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.92 
 
 		 409 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.88 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 414 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.93 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  29.17 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  27.46 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  26.63 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  24.81 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  25.06 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  25.41 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  30.03 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  24.81 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  24.81 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  24.81 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  24.81 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  24.81 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>