78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0368 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  100 
 
 		 416 aa  843    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  84.62 
 
 		 414 aa  706    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  70.57 
 
 		 414 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  63.46 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  58.8 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  26.1 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  27.1 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  25 
 
 		 870 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  23.37 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  24.46 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  21.37 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  26.98 
 
 		 1223 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  26.99 
 
 		 553 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  25.43 
 
 		 913 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  25.57 
 
 		 1222 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.34 
 
 		 795 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.34 
 
 		 795 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.34 
 
 		 795 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.37 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.79 
 
 		 804 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  30.68 
 
 		 917 aa  50.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  20.48 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  26.78 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  27.57 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.79 
 
 		 803 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.79 
 
 		 803 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.02 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.02 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.02 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.02 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.02 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  26.02 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.24 
 
 		 805 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  20.53 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  26.02 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.02 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.44 
 
 		 815 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  31.4 
 
 		 913 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  25.38 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  25.95 
 
 		 683 aa  47  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1224 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.51 
 
 		 810 aa  47  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1257  surface antigen (D15)  24.73 
 
 		 824 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00322017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  28.72 
 
 		 772 aa  47  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  20.97 
 
 		 374 aa  46.6  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.59 
 
 		 809 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.77 
 
 		 805 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.16 
 
 		 803 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  24.04 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  26.92 
 
 		 913 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  23.5 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  23.78 
 
 		 855 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.74 
 
 		 804 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.44 
 
 		 807 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  23.44 
 
 		 886 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01381  outer membrane protein, OMP85 family  26.88 
 
 		 825 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.28 
 
 		 810 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  28.16 
 
 		 804 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.28 
 
 		 810 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  25.52 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  22.55 
 
 		 844 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  20.79 
 
 		 610 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  23.57 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.34 
 
 		 574 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.47 
 
 		 920 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  19.65 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  28.67 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  25.43 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  35.11 
 
 		 587 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 827 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  27.33 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0980  surface antigen  32.95 
 
 		 802 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00787602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  25.43 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  25.38 
 
 		 844 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  30.68 
 
 		 925 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  23.21 
 
 		 637 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  23.15 
 
 		 827 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  25.52 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>