158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6183 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6183  selenocysteine synthase  100 
 
 		 455 aa  866    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0439  selenocysteine synthase  68.42 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3738  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  55.95 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241783  normal  0.0172698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5689  L-seryl-tRNA selenium transferase  53.18 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5215  selenocysteine synthase  57.14 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5303  selenocysteine synthase  57.14 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5595  selenocysteine synthase  57.14 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0584  selenocysteine synthase  53.32 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1631  L-seryl-tRNA selenium transferase  54.55 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04250  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  61.84 
 
 		 458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1608  selenocysteine synthase  57.22 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0237465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16930  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  48.1 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211472  normal  0.41597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5281  selenocysteine synthase  62.37 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3579  L-seryl-tRNA selenium transferase  48.63 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09650  selenocysteine synthase  52.66 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  37.9 
 
 		 462 aa  230  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  50.57 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0812  L-seryl-tRNA selenium transferase  37.16 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  50.19 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  50.19 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  50.19 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  50.19 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  50.19 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  50.19 
 
 		 480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3060  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  38.52 
 
 		 491 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000814567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2152  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  44.33 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  42.75 
 
 		 470 aa  223  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  34.69 
 
 		 475 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  47.28 
 
 		 468 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3988  selenocysteine synthase  47.91 
 
 		 479 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3540  selenocysteine synthase  47.91 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0760  selenocysteine synthase  43.18 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306605  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  35.01 
 
 		 476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  44.44 
 
 		 468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  33.75 
 
 		 462 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  39.45 
 
 		 473 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  45.53 
 
 		 476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  33.5 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2867  selenocysteine synthase  39.9 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  35.81 
 
 		 471 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  40.47 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1546  selenocysteine synthase  29.87 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  34.6 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  36.87 
 
 		 476 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  40.52 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  38.18 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  36.87 
 
 		 476 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  36.87 
 
 		 473 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  36.62 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  37.63 
 
 		 475 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  41.89 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  45.14 
 
 		 478 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  34.15 
 
 		 476 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  41.55 
 
 		 468 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3883  selenocysteine synthase  46.77 
 
 		 479 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  38.89 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  46.77 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  36 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  36.76 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  36.76 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  38.35 
 
 		 446 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  41.14 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  45.02 
 
 		 475 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  44.85 
 
 		 465 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  44.44 
 
 		 476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0765  L-seryl-tRNA selenium transferase  32.28 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.522445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  44.07 
 
 		 475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  39.29 
 
 		 491 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0442  selenocysteine synthase  42.81 
 
 		 496 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  44.07 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4593  selenocysteine synthase  49.05 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.263518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  44.07 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  41.63 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  38.82 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  43.4 
 
 		 462 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  43.4 
 
 		 462 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  36.21 
 
 		 468 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0506  selenocysteine synthase  43.41 
 
 		 468 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.487693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3369  selenocysteine synthase  37.47 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  48.64 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0412  selenocysteine synthase  39.13 
 
 		 491 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  43.4 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0658  selenocysteine synthase  36.17 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2549  selenocysteine synthase  46.3 
 
 		 476 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3265  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  38.79 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.322866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  45.63 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  45.28 
 
 		 489 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0768  L-seryl-tRNA selenium transferase  42.3 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.204194  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  39.65 
 
 		 466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  36.28 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  36.68 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  37.5 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  43.97 
 
 		 506 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0594  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  52.8 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  36.86 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3961  selenocysteine synthase  41.5 
 
 		 463 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4068  selenocysteine synthase  41.5 
 
 		 463 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4006  selenocysteine synthase  41.5 
 
 		 463 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3883  selenocysteine synthase  41.5 
 
 		 463 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5143  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  49.28 
 
 		 480 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>