More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2200 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  80.45 
 
 		 442 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  78.95 
 
 		 261 aa  216  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  79.7 
 
 		 249 aa  215  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  80.65 
 
 		 267 aa  204  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  82.35 
 
 		 192 aa  201  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  77.44 
 
 		 356 aa  200  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  81.36 
 
 		 461 aa  199  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  77.95 
 
 		 442 aa  199  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  77.95 
 
 		 442 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  76.69 
 
 		 356 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  57.42 
 
 		 420 aa  160  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  65.06 
 
 		 405 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  57.5 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  60.71 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  52.59 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  55.06 
 
 		 363 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  51.11 
 
 		 393 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  51.11 
 
 		 393 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  49.5 
 
 		 409 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  44.35 
 
 		 399 aa  99.4  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  57.14 
 
 		 377 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  47.83 
 
 		 393 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  56.04 
 
 		 377 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  56.47 
 
 		 410 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  54.35 
 
 		 383 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  44 
 
 		 384 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  54.12 
 
 		 410 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.37 
 
 		 391 aa  93.6  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  52.94 
 
 		 405 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  52.17 
 
 		 381 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  52.94 
 
 		 410 aa  91.3  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  43.02 
 
 		 300 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  43.02 
 
 		 393 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  47.62 
 
 		 408 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  54.76 
 
 		 373 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  48.89 
 
 		 398 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  48.89 
 
 		 398 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  51.65 
 
 		 377 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  47.67 
 
 		 393 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.91 
 
 		 381 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 		 381 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  43 
 
 		 393 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  41.86 
 
 		 370 aa  87.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  50 
 
 		 368 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1540  IS605 family transposase OrfB  41.67 
 
 		 223 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  40.7 
 
 		 370 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40 
 
 		 395 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  46.51 
 
 		 427 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  43.12 
 
 		 381 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  51.16 
 
 		 405 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  50.55 
 
 		 375 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  46.67 
 
 		 292 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  46.51 
 
 		 390 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  51.09 
 
 		 376 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  47.78 
 
 		 398 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  55.42 
 
 		 406 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  43.02 
 
 		 377 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  44.58 
 
 		 403 aa  84.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  46.43 
 
 		 381 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  41.05 
 
 		 382 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  40.7 
 
 		 393 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  50.63 
 
 		 399 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  50.63 
 
 		 399 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  40.7 
 
 		 370 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  40.7 
 
 		 370 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  42.86 
 
 		 372 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  46.46 
 
 		 424 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  45.05 
 
 		 362 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  38.37 
 
 		 370 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  43.82 
 
 		 450 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  46.51 
 
 		 392 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  48.19 
 
 		 390 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  43.02 
 
 		 382 aa  83.6  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  43.82 
 
 		 392 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  46.15 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  37.93 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  40.7 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  44.05 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  43.69 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  43.69 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  43.69 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  37.21 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  43.53 
 
 		 394 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  43.69 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  44.19 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  43.69 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  45.35 
 
 		 377 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  43.53 
 
 		 394 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  46.43 
 
 		 367 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  37.21 
 
 		 370 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  46.43 
 
 		 367 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  45.78 
 
 		 402 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  39.13 
 
 		 403 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  46.02 
 
 		 460 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  45.05 
 
 		 391 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  38.82 
 
 		 269 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  41.57 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  41.57 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  41.57 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>