More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0811 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  100 
 
 
269 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  86.25 
 
 
390 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  86.25 
 
 
399 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  85.5 
 
 
387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  84.76 
 
 
396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  83.27 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  78.81 
 
 
387 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  64.81 
 
 
394 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  63.33 
 
 
299 aa  294  8e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  63.7 
 
 
394 aa  291  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  55.39 
 
 
385 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0728  transposase, IS605 family  56.51 
 
 
385 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  54.48 
 
 
385 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  54.48 
 
 
385 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  54.28 
 
 
385 aa  280  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1479  ISCpe4, transposase  86.96 
 
 
166 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000438006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  60.29 
 
 
395 aa  267  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  56.35 
 
 
372 aa  218  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  56.35 
 
 
372 aa  218  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4124  transposase  62.99 
 
 
129 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  35 
 
 
393 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0198  ISCpe4, transposase  84.44 
 
 
90 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00422842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  37.5 
 
 
409 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  33.88 
 
 
440 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  34.36 
 
 
363 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  34.6 
 
 
399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  40.08 
 
 
403 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  32.94 
 
 
399 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  32.94 
 
 
399 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  35.27 
 
 
393 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  35.27 
 
 
393 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  31.97 
 
 
398 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  31.97 
 
 
398 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  31.97 
 
 
398 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  34.98 
 
 
393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  34.1 
 
 
383 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  32.32 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  32.32 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  32.32 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  32.32 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  32.32 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  36.73 
 
 
450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  36.73 
 
 
392 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  31.43 
 
 
442 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  32.79 
 
 
356 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  32.69 
 
 
377 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0940  ISCpe4, transposase  89.04 
 
 
93 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0783043  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  32.69 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  32.39 
 
 
356 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  36.22 
 
 
427 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  36.22 
 
 
390 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  31.43 
 
 
442 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  30.35 
 
 
368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.71 
 
 
391 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0197  transposase, putative  86.49 
 
 
79 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000538079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  31.43 
 
 
442 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  36.84 
 
 
383 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  32.24 
 
 
461 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  35.63 
 
 
383 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  35.63 
 
 
383 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  31.25 
 
 
292 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  35.03 
 
 
405 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4234  IS605 family transposase OrfB  37.2 
 
 
299 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  30.74 
 
 
261 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  31.48 
 
 
370 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  36.44 
 
 
383 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  34.77 
 
 
394 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  31.48 
 
 
370 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  34.69 
 
 
392 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  34.77 
 
 
394 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
402 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  37.75 
 
 
370 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
402 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  34.18 
 
 
392 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
402 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  32.64 
 
 
382 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  31.92 
 
 
382 aa  122  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  32.55 
 
 
405 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  31.11 
 
 
370 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  36.55 
 
 
370 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  38.15 
 
 
370 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  33.85 
 
 
383 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  35.97 
 
 
370 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.14 
 
 
461 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  33.85 
 
 
393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  35.12 
 
 
373 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  36.87 
 
 
373 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  36.29 
 
 
311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  32.34 
 
 
406 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  39.39 
 
 
383 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.12 
 
 
373 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  35.57 
 
 
370 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.95 
 
 
402 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  34.41 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  36.55 
 
 
393 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  34.41 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  34.41 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  34.41 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  36.29 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  35.18 
 
 
300 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>