More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1479 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1479  ISCpe4, transposase  100 
 
 		 166 aa  328  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000438006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  88.2 
 
 		 387 aa  281  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  86.34 
 
 		 390 aa  271  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  86.96 
 
 		 269 aa  269  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  85 
 
 		 387 aa  266  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  80.12 
 
 		 396 aa  247  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  80.12 
 
 		 399 aa  246  9e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  81.17 
 
 		 387 aa  228  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  69.23 
 
 		 394 aa  179  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  67.95 
 
 		 299 aa  174  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  67.95 
 
 		 394 aa  174  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  53.55 
 
 		 385 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  53.55 
 
 		 385 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0728  transposase, IS605 family  53.55 
 
 		 385 aa  156  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  54.19 
 
 		 385 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  54.19 
 
 		 385 aa  153  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0940  ISCpe4, transposase  93.33 
 
 		 93 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0783043  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  57.69 
 
 		 395 aa  133  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  48.99 
 
 		 372 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  48.99 
 
 		 372 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3476  IS605 family transposase  35.76 
 
 		 379 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0814694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4575  IS605 family transposase  37.09 
 
 		 376 aa  87.8  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5163  transposase, IS605 family  36.42 
 
 		 376 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3199  IS605 family transposase  35.76 
 
 		 376 aa  87  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4124  transposase  55.26 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1098  IS605 family transposase  36.42 
 
 		 376 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3042  IS605 family transposase OrfB  36.08 
 
 		 376 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0472  IS605 family transposase  37.09 
 
 		 376 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  37.01 
 
 		 332 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0945  IS605 family transposase  35.76 
 
 		 376 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  38.41 
 
 		 372 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1010  IS605 family transposase  35.76 
 
 		 376 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  38.93 
 
 		 372 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  38.41 
 
 		 372 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  36.84 
 
 		 259 aa  84  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  37.09 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  37.86 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  36.36 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0197  transposase, putative  82 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000538079  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  37.75 
 
 		 372 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  37.86 
 
 		 383 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  36.42 
 
 		 373 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  39.29 
 
 		 383 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  38.41 
 
 		 373 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  36.36 
 
 		 373 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  36.36 
 
 		 373 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  36.36 
 
 		 373 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 		 403 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 		 403 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 		 403 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 		 403 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  35.66 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  31.65 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4234  IS605 family transposase OrfB  36 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  27.45 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  35.51 
 
 		 363 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.18 
 
 		 406 aa  73.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  32.65 
 
 		 384 aa  73.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  31.85 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  33.57 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  32.65 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  32.65 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  31.47 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  28.99 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  31.47 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  36.57 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  35.51 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  31.47 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  31.97 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  31.97 
 
 		 384 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  31.97 
 
 		 384 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  33.79 
 
 		 388 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  29.59 
 
 		 403 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  32.86 
 
 		 384 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  32.86 
 
 		 384 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  32.86 
 
 		 383 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  32.86 
 
 		 384 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  29.59 
 
 		 403 aa  71.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  32.86 
 
 		 384 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  32.86 
 
 		 384 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  32.86 
 
 		 384 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  33.97 
 
 		 383 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  27.66 
 
 		 377 aa  70.9  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  29.49 
 
 		 383 aa  70.9  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  30.07 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  32.14 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  32.14 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  29.75 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  26.71 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  34.97 
 
 		 394 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  34.97 
 
 		 394 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  29.8 
 
 		 410 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  27.27 
 
 		 410 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  37.41 
 
 		 370 aa  68.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.78 
 
 		 372 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>