47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0940 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0940  ISCpe4, transposase  100 
 
 		 93 aa  186  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0783043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  94.67 
 
 		 387 aa  144  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1479  ISCpe4, transposase  93.33 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000438006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  90.41 
 
 		 387 aa  133  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  90.41 
 
 		 390 aa  130  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  89.04 
 
 		 269 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  83.33 
 
 		 387 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  84.93 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  84.93 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  72.22 
 
 		 394 aa  99.4  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  69.44 
 
 		 299 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  69.44 
 
 		 394 aa  94.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  57.33 
 
 		 395 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  48.05 
 
 		 385 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  50.67 
 
 		 385 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  50.67 
 
 		 385 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  47.95 
 
 		 385 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0728  transposase, IS605 family  43.84 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  41.89 
 
 		 402 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  43.24 
 
 		 402 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  43.24 
 
 		 399 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  39.56 
 
 		 402 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  43.24 
 
 		 402 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4124  transposase  48.57 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  43.24 
 
 		 387 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  43.24 
 
 		 382 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  43.24 
 
 		 402 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  43.24 
 
 		 382 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  43.24 
 
 		 402 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  43.24 
 
 		 402 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  43.24 
 
 		 402 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  43.24 
 
 		 402 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  37.84 
 
 		 411 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  43.24 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  50 
 
 		 372 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  50 
 
 		 372 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  50 
 
 		 372 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  41.89 
 
 		 402 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  40.79 
 
 		 383 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.9 
 
 		 435 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  51.06 
 
 		 259 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  48.15 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  40.79 
 
 		 383 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  47.92 
 
 		 402 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  31.11 
 
 		 372 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  48.15 
 
 		 372 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  31.11 
 
 		 372 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>