More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3084 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  98.22 
 
 
394 aa  787    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
394 aa  798    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  95.37 
 
 
299 aa  518  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  63.13 
 
 
387 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  60.99 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  60.61 
 
 
387 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  60.86 
 
 
390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  61.62 
 
 
387 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  60.25 
 
 
399 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  54.52 
 
 
385 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0728  transposase, IS605 family  55.84 
 
 
385 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  54.06 
 
 
385 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  53.67 
 
 
385 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  53.67 
 
 
385 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  53.83 
 
 
395 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  64.81 
 
 
269 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  38.14 
 
 
372 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  38.14 
 
 
372 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1479  ISCpe4, transposase  69.23 
 
 
166 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000438006  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  32.72 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  30.85 
 
 
398 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  37.28 
 
 
363 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  30.85 
 
 
398 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  33.76 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  30.85 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  33.76 
 
 
383 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
383 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  28.99 
 
 
382 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  31.79 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  29.43 
 
 
377 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.08 
 
 
383 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.31 
 
 
391 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  31.73 
 
 
369 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  31.73 
 
 
369 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  31.73 
 
 
369 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  31.73 
 
 
369 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  31.73 
 
 
369 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  29.76 
 
 
378 aa  177  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  32.65 
 
 
405 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  31.12 
 
 
399 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  31.12 
 
 
399 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  33.16 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  29.43 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  33.08 
 
 
372 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  33.33 
 
 
372 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  32.05 
 
 
409 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  30.08 
 
 
393 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  32.05 
 
 
373 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  31.88 
 
 
373 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  31.08 
 
 
383 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  33.08 
 
 
372 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  30.23 
 
 
404 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  31.08 
 
 
383 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  31.08 
 
 
383 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  30.23 
 
 
404 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  31.08 
 
 
383 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  31.36 
 
 
393 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  31.46 
 
 
370 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  32.31 
 
 
383 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  32.48 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4124  transposase  60.94 
 
 
129 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  31.88 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  31.54 
 
 
373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  31.97 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  31.22 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  31.88 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  35.4 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  35.4 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  31.54 
 
 
373 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  31.54 
 
 
373 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  30.33 
 
 
383 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  31.54 
 
 
373 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  32.56 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  28.4 
 
 
442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  28.17 
 
 
381 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  28.4 
 
 
442 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  30.69 
 
 
370 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  30.02 
 
 
402 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  31.91 
 
 
373 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  30.46 
 
 
370 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2896  IS605 family transposase OrfB  31.35 
 
 
370 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  29.56 
 
 
335 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  30.34 
 
 
387 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  26.44 
 
 
442 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3471  IS605 family transposase  30.91 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  31.46 
 
 
370 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3745  IS605 family transposase  30.91 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0235026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 
370 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3700  transposase, IS605 family  30.91 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000048938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  29.4 
 
 
450 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  29.4 
 
 
392 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  30.15 
 
 
427 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3437  IS605 family transposase  30.91 
 
 
370 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  30.15 
 
 
390 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  30.2 
 
 
367 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  29.44 
 
 
367 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  30.1 
 
 
402 aa  159  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  30.43 
 
 
370 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  28.57 
 
 
376 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>