More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0468 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
299 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  95.37 
 
 
394 aa  518  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  95.02 
 
 
394 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  68.98 
 
 
390 aa  374  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  68.98 
 
 
387 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  67.14 
 
 
396 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  66.78 
 
 
399 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  66.42 
 
 
387 aa  362  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  67.88 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0728  transposase, IS605 family  59.27 
 
 
385 aa  318  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  63.33 
 
 
269 aa  315  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  57.82 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  57.82 
 
 
385 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  56.41 
 
 
385 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  56.41 
 
 
385 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  57.65 
 
 
395 aa  291  6e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1479  ISCpe4, transposase  67.95 
 
 
166 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000438006  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  41.76 
 
 
372 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  41.76 
 
 
372 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4124  transposase  60.94 
 
 
129 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  41.09 
 
 
363 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  35.85 
 
 
393 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
399 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  32.69 
 
 
398 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  32.69 
 
 
398 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  32.69 
 
 
398 aa  148  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  35.04 
 
 
409 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  36.19 
 
 
393 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  36.19 
 
 
393 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  33.46 
 
 
292 aa  146  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  35 
 
 
440 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  34.75 
 
 
369 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  34.75 
 
 
369 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  34.75 
 
 
369 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  34.75 
 
 
369 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  34.75 
 
 
369 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  35.59 
 
 
405 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  32.13 
 
 
383 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.93 
 
 
391 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  37.02 
 
 
403 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  36.59 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  36.59 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  34.48 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  34.48 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  33.33 
 
 
393 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35 
 
 
381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  31.93 
 
 
356 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  36.86 
 
 
372 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  32.35 
 
 
377 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  37.33 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  31.51 
 
 
356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  34.18 
 
 
383 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  31.95 
 
 
382 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  35.69 
 
 
372 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  34.55 
 
 
383 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  35.69 
 
 
373 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  35.69 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  31.58 
 
 
450 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  31.58 
 
 
392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  31.95 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  34.06 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  34.06 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  35.69 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  36.47 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  34.06 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  34.15 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  35.25 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  30.77 
 
 
442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  37.89 
 
 
383 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  31.22 
 
 
442 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  34.9 
 
 
373 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  31.95 
 
 
382 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  30.84 
 
 
261 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  29.77 
 
 
461 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  31.93 
 
 
427 aa  125  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  31.22 
 
 
442 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0198  ISCpe4, transposase  68.13 
 
 
90 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00422842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  34.25 
 
 
373 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  31.93 
 
 
390 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  32.16 
 
 
368 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  34.39 
 
 
370 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4234  IS605 family transposase OrfB  33.72 
 
 
299 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596003 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  34.39 
 
 
370 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  30.9 
 
 
335 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  33.86 
 
 
259 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.88 
 
 
376 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  31.23 
 
 
392 aa  122  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  34.82 
 
 
373 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.9 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  32.89 
 
 
367 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.9 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.9 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  34.93 
 
 
402 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  32.89 
 
 
367 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  31.65 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  30.18 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  33.86 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  32.31 
 
 
381 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  33.33 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  33.47 
 
 
384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>