17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0197 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0197  transposase, putative  100 
 
 
79 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000538079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  86.49 
 
 
269 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  70.27 
 
 
399 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  66.22 
 
 
396 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  80.77 
 
 
387 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1479  ISCpe4, transposase  82 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000438006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  75 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  69.39 
 
 
387 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  44 
 
 
372 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  44 
 
 
372 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0728  transposase, IS605 family  55.1 
 
 
385 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  66.67 
 
 
387 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  54.35 
 
 
385 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  54.35 
 
 
385 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  54.35 
 
 
385 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4123  OrfB family transposase  54.35 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00660809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  52.08 
 
 
385 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>