228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0198 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0198  ISCpe4, transposase  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00422842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  87.78 
 
 		 390 aa  161  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  86.67 
 
 		 387 aa  160  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  84.44 
 
 		 269 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  82.22 
 
 		 387 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  81.11 
 
 		 387 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  82.22 
 
 		 399 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  81.11 
 
 		 396 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  68.13 
 
 		 299 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  67.03 
 
 		 394 aa  121  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  64.84 
 
 		 394 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  65.17 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  65.17 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0728  transposase, IS605 family  65.17 
 
 		 385 aa  110  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4124  transposase  62.92 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  62.64 
 
 		 395 aa  110  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  62.92 
 
 		 385 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  58.43 
 
 		 385 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  50 
 
 		 372 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  50 
 
 		 372 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  49.4 
 
 		 363 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  46.91 
 
 		 393 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  46.34 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  41.98 
 
 		 440 aa  74.3  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  41.67 
 
 		 292 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  40.48 
 
 		 398 aa  70.1  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  40.48 
 
 		 398 aa  70.1  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  37.21 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  37.21 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  37.21 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  37.21 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  37.21 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  41.25 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  40.48 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  40.74 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  41.25 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  40.96 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  40.24 
 
 		 405 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  41.67 
 
 		 393 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  41.67 
 
 		 393 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2486  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  60.87 
 
 		 380 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  41.25 
 
 		 370 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  36.9 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1479  ISCpe4, transposase  86.84 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000438006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  39.29 
 
 		 461 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  34.52 
 
 		 267 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  35.71 
 
 		 249 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  35.71 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.71 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4234  IS605 family transposase OrfB  42.35 
 
 		 299 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  38.27 
 
 		 384 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 383 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  35.8 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  35.71 
 
 		 442 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  35.37 
 
 		 399 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  35.37 
 
 		 399 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  38.27 
 
 		 293 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  35.71 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  44.44 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0256  ISHa1675 transposase B  39.58 
 
 		 413 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  36.59 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1726  ISHa1675 transposase B  39.58 
 
 		 413 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.773087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2896  IS605 family transposase OrfB  36.71 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1254  ISHa1675 transposase B  39.58 
 
 		 413 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0163601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  30.95 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  35.8 
 
 		 393 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  35.71 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3471  IS605 family transposase  35.44 
 
 		 370 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3700  transposase, IS605 family  35.44 
 
 		 370 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000048938 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3745  IS605 family transposase  35.44 
 
 		 370 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0235026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 		 383 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 		 383 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 		 383 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 		 383 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 		 383 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 		 383 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2489  IS605 family transposase OrfB  34.52 
 
 		 256 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  37.35 
 
 		 377 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3437  IS605 family transposase  35.44 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2865  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.3 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.931396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  34.52 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  38.55 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  35.37 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  37.65 
 
 		 410 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  39.02 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  38.55 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  37.65 
 
 		 405 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.55 
 
 		 381 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  36.14 
 
 		 382 aa  55.1  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  36.14 
 
 		 378 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  34.15 
 
 		 391 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  38.55 
 
 		 370 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  36.47 
 
 		 410 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  31.13 
 
 		 420 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 383 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2321  transposase, IS605 OrfB family  43.04 
 
 		 374 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  35.37 
 
 		 381 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  35.37 
 
 		 377 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.86 
 
 		 376 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>