More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2489 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2489  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
256 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4234  IS605 family transposase OrfB  65.67 
 
 
299 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  60.08 
 
 
397 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  60.08 
 
 
397 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  64.84 
 
 
391 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  48.51 
 
 
405 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  46.56 
 
 
404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  46.56 
 
 
404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  47.23 
 
 
399 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  45.41 
 
 
384 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  48.79 
 
 
304 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  46.38 
 
 
396 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  45.41 
 
 
394 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  45.41 
 
 
394 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  45.02 
 
 
381 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  47.89 
 
 
370 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  44.98 
 
 
405 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  44.98 
 
 
405 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.29 
 
 
381 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  46.52 
 
 
408 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  46.36 
 
 
386 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  44.96 
 
 
416 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  47.42 
 
 
370 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  46.95 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  41.32 
 
 
461 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  47.42 
 
 
370 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  46.48 
 
 
370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  43.89 
 
 
402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  46.95 
 
 
370 aa  197  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  47.42 
 
 
370 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  46.95 
 
 
370 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.47 
 
 
372 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  47.42 
 
 
393 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  46.91 
 
 
410 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  46.95 
 
 
370 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  51.76 
 
 
390 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  51.96 
 
 
417 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  44.1 
 
 
373 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  46.01 
 
 
300 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  46.01 
 
 
393 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  46.38 
 
 
394 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  46.01 
 
 
370 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  47.14 
 
 
395 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  46.08 
 
 
367 aa  191  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  47.53 
 
 
377 aa  191  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  44.91 
 
 
367 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  45.41 
 
 
391 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  45.27 
 
 
410 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  46.12 
 
 
368 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  46.29 
 
 
391 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  44.44 
 
 
405 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  50.98 
 
 
403 aa  185  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  45 
 
 
440 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  44.29 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  43.69 
 
 
326 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.65 
 
 
376 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  43.33 
 
 
383 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  43.33 
 
 
383 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  43.33 
 
 
383 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  43.33 
 
 
383 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  41.63 
 
 
403 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  42.92 
 
 
384 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  44.39 
 
 
362 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  44.86 
 
 
405 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  42.92 
 
 
384 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  42.92 
 
 
384 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  45.66 
 
 
391 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.19 
 
 
381 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  42.45 
 
 
384 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  42.45 
 
 
384 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  42.45 
 
 
384 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  42.45 
 
 
384 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  42.45 
 
 
384 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  45.68 
 
 
410 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  41.98 
 
 
384 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2321  transposase, IS605 OrfB family  42.73 
 
 
374 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  41.98 
 
 
384 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  41.98 
 
 
384 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  45.99 
 
 
406 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  42.86 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  42.86 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  41.98 
 
 
384 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  41.9 
 
 
383 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  41.9 
 
 
383 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  41.98 
 
 
384 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  41.98 
 
 
383 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  42.45 
 
 
384 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  44.39 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  45.37 
 
 
377 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  41.51 
 
 
384 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  43.23 
 
 
373 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  43.23 
 
 
373 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  43.23 
 
 
373 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  44.39 
 
 
370 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  41.45 
 
 
388 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  43.23 
 
 
372 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  43.32 
 
 
372 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  40.53 
 
 
378 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  42.71 
 
 
373 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  43.23 
 
 
373 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>