More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2297 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  90.85 
 
 		 461 aa  303  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  83.59 
 
 		 442 aa  225  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  84.5 
 
 		 442 aa  224  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  82.03 
 
 		 261 aa  223  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  86.72 
 
 		 356 aa  223  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  83.72 
 
 		 442 aa  221  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  85.94 
 
 		 356 aa  221  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  82.03 
 
 		 249 aa  221  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  71.52 
 
 		 267 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  82.35 
 
 		 134 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  60 
 
 		 420 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  65.59 
 
 		 405 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  56.92 
 
 		 440 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  53.47 
 
 		 393 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  53.47 
 
 		 393 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  56.57 
 
 		 363 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  57.84 
 
 		 293 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  51.35 
 
 		 409 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  47.75 
 
 		 384 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  53.33 
 
 		 383 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  50 
 
 		 393 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  58.33 
 
 		 410 aa  111  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  46.85 
 
 		 393 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  47.73 
 
 		 399 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  56.25 
 
 		 405 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  56.25 
 
 		 410 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  56.99 
 
 		 377 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  49.14 
 
 		 398 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  49.14 
 
 		 398 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  50.96 
 
 		 381 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.53 
 
 		 391 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  55.91 
 
 		 377 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  49.04 
 
 		 381 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  55.79 
 
 		 410 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  48.28 
 
 		 398 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  48.03 
 
 		 405 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  50.49 
 
 		 368 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  76.81 
 
 		 132 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  49.04 
 
 		 381 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 		 394 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  44.07 
 
 		 403 aa  102  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  44.07 
 
 		 393 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 		 394 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  51.46 
 
 		 376 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  47.87 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  46.96 
 
 		 399 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  46.96 
 
 		 399 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  47.37 
 
 		 396 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  52.69 
 
 		 395 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  48.2 
 
 		 406 aa  98.6  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0811  ISCpe4, transposase  44.21 
 
 		 269 aa  98.6  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000260931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  45.26 
 
 		 387 aa  98.6  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  45.83 
 
 		 292 aa  97.8  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  49.46 
 
 		 402 aa  97.8  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  50.51 
 
 		 377 aa  97.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  42.37 
 
 		 427 aa  97.8  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  41.96 
 
 		 408 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  45.26 
 
 		 399 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  44.55 
 
 		 390 aa  96.3  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  45.26 
 
 		 390 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  43.75 
 
 		 300 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1540  IS605 family transposase OrfB  41.96 
 
 		 223 aa  95.9  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  51.58 
 
 		 373 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  43.75 
 
 		 393 aa  95.5  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  43.75 
 
 		 381 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  44.21 
 
 		 387 aa  95.1  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  44.21 
 
 		 387 aa  95.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  45.74 
 
 		 391 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  41.41 
 
 		 403 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  41.41 
 
 		 403 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  47.37 
 
 		 405 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  41.41 
 
 		 403 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  41.41 
 
 		 403 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  45.74 
 
 		 391 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  42.71 
 
 		 370 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  50.54 
 
 		 375 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  43.75 
 
 		 372 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  44.36 
 
 		 417 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  46.39 
 
 		 377 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  42.71 
 
 		 370 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  42.71 
 
 		 370 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  42.71 
 
 		 370 aa  93.6  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  45.74 
 
 		 403 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  45.74 
 
 		 450 aa  92.8  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  41.53 
 
 		 392 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  40.62 
 
 		 403 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  40.21 
 
 		 373 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  42.71 
 
 		 393 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  45.74 
 
 		 392 aa  92.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  45.87 
 
 		 424 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  42.71 
 
 		 370 aa  92  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  42.27 
 
 		 377 aa  92  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  40.68 
 
 		 392 aa  92  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  41.83 
 
 		 460 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  40.21 
 
 		 373 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  43.16 
 
 		 395 aa  91.7  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  40.91 
 
 		 381 aa  91.3  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  41.41 
 
 		 384 aa  90.9  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  39.29 
 
 		 399 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>