More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1615 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  100 
 
 
420 aa  855    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  64.58 
 
 
442 aa  559  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  63.64 
 
 
442 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  63.85 
 
 
442 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  60.31 
 
 
461 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  56.69 
 
 
356 aa  348  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  56.4 
 
 
356 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  53.71 
 
 
261 aa  263  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  62.91 
 
 
249 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  37.64 
 
 
405 aa  242  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  36.87 
 
 
440 aa  225  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  37.41 
 
 
383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12804  transposase  35.73 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00653678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  35.25 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  34.89 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  49.2 
 
 
267 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  34.39 
 
 
399 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  34.32 
 
 
398 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  34.32 
 
 
398 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10940  transposase  35.08 
 
 
550 aa  196  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  34.07 
 
 
398 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13861  transposase  34.47 
 
 
407 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  33.74 
 
 
409 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 
363 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.57 
 
 
410 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  33.24 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  32.52 
 
 
393 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  32.52 
 
 
393 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  34.32 
 
 
393 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  33.17 
 
 
399 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  33.17 
 
 
399 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  59.6 
 
 
192 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3268  hypothetical protein  78.43 
 
 
112 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.220278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  32.75 
 
 
368 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  32.84 
 
 
410 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  57.42 
 
 
134 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  33.08 
 
 
405 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.83 
 
 
391 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  28.33 
 
 
405 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  28.26 
 
 
372 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  27.61 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  31.67 
 
 
405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1968  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  61.59 
 
 
197 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304604  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  32.76 
 
 
410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  28.01 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  31.38 
 
 
377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  32.75 
 
 
377 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  32.65 
 
 
377 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  27.55 
 
 
384 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  27.32 
 
 
384 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  27.55 
 
 
384 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  29.17 
 
 
417 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  28.15 
 
 
383 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  28.15 
 
 
383 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  28.15 
 
 
383 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  28.15 
 
 
383 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  27.32 
 
 
384 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  39.79 
 
 
403 aa  142  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  27.32 
 
 
384 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.07 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  26.93 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  26.32 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  27.08 
 
 
384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  26.62 
 
 
370 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  27.55 
 
 
383 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  30.31 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  27.08 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  27.32 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  27.08 
 
 
384 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  27.08 
 
 
384 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  27.08 
 
 
384 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  26.84 
 
 
384 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  25.6 
 
 
370 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  25.84 
 
 
393 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  29.07 
 
 
395 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  27.08 
 
 
384 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  26.43 
 
 
373 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  25.9 
 
 
393 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  26.32 
 
 
370 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  28.8 
 
 
404 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  26.84 
 
 
384 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  27.82 
 
 
399 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.54 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  32.79 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  28.25 
 
 
393 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  26.49 
 
 
370 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  29.72 
 
 
404 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  26.93 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  28 
 
 
383 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  29.49 
 
 
425 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  26.6 
 
 
384 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  27.05 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  26.32 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  28 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  27.05 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  27.05 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  26.93 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  27.05 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  24.94 
 
 
370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  26.8 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>