More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1968 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1968  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  60.23 
 
 		 442 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  67.39 
 
 		 442 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  67.39 
 
 		 442 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  66.67 
 
 		 461 aa  184  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  56.25 
 
 		 356 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  56.25 
 
 		 356 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  59.24 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  61.59 
 
 		 420 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  43.95 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  45.6 
 
 		 383 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  44.8 
 
 		 398 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  44 
 
 		 292 aa  90.5  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  44 
 
 		 398 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  44 
 
 		 335 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  44 
 
 		 398 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 		 363 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  39.68 
 
 		 410 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  40.48 
 
 		 370 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  42.02 
 
 		 399 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  42.02 
 
 		 399 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  45.45 
 
 		 368 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  40.29 
 
 		 410 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  44.35 
 
 		 410 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 		 363 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  38.89 
 
 		 370 aa  84.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  38.1 
 
 		 373 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  39.47 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  37.5 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  37.82 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  38.52 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  37.82 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  42.61 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  37.5 
 
 		 373 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  39.47 
 
 		 362 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  36.72 
 
 		 372 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  44.92 
 
 		 399 aa  81.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  36.72 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  36.59 
 
 		 304 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  35.94 
 
 		 259 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  36.72 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  36.72 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  36.72 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  33.81 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  36.72 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  36.72 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  37.5 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  32.58 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.52 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  38.98 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  32.58 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  32.82 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  34.71 
 
 		 394 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  35.25 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  35.09 
 
 		 406 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  34.4 
 
 		 399 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  32.82 
 
 		 363 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  32.82 
 
 		 363 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  34.11 
 
 		 403 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  35.34 
 
 		 363 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  34.45 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  32.82 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  32.06 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  36.13 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  32.62 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  36.13 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  34.92 
 
 		 391 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  36.57 
 
 		 425 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  36.13 
 
 		 403 aa  75.5  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  36.69 
 
 		 424 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.4 
 
 		 361 aa  75.1  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  33.09 
 
 		 405 aa  75.1  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  32.79 
 
 		 370 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  33.33 
 
 		 397 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  33.33 
 
 		 397 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  39.13 
 
 		 405 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  31.65 
 
 		 348 aa  74.7  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  31.65 
 
 		 348 aa  74.7  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  35.71 
 
 		 373 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  34.15 
 
 		 405 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.83 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  35.29 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  40 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  35.29 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  33.57 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.88 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  35.29 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  35.29 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  33.87 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  40 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  35.29 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  36.29 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  32.23 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4234  IS605 family transposase OrfB  34.38 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  37.31 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.45 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  37.19 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  34.71 
 
 		 403 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>