More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1815 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 136 aa  270  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  74.05 
 
 		 131 aa  204  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  47.73 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  47.73 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  46.97 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  46.27 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  48.48 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  47.69 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  45.8 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  44.7 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.69 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  43.18 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  43.85 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  43.85 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  39.23 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  40.19 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  38.28 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  34.62 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  30.15 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.05 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  30.37 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  28.36 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  32.59 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  31.34 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.33 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  36.23 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  32.35 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  31.62 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  29.2 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  36.08 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  36.63 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  28.68 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  29.81 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  37.62 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  28.89 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  30.66 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  32.09 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  30.22 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  33.66 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  33.66 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  33.66 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  33.66 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  33.66 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  33.66 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  33.66 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  30.88 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  27.19 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  27.19 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  31.07 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  30.88 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  27.19 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  27.94 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.58 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  31.39 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  29.77 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4657  HIT family protein  31.68 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000190744  hitchhiker  3.0087100000000003e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  32.67 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  29.93 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  27.83 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003256  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (asymmetrical)  29.81 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0774  HIT family protein  31.68 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000367298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  32.67 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  32.67 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0557  hydrolase HIT family  30.69 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000022236  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0702  hydrolase, HIT family  30.69 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>