More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003256 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003256  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (asymmetrical)  100 
 
 
133 aa  277  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3180  histidine triad (HIT) protein  58.4 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 
146 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  37.7 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  38.66 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  33.85 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0556  HIT (histidine triad) family protein  37.74 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000140034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0681  HIT  37.74 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0189607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4657  HIT family protein  39.62 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000190744  hitchhiker  3.0087100000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  33.86 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0774  HIT family protein  37.74 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000367298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0557  hydrolase HIT family  37.74 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000022236  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0713  HIT family protein  37.74 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0612  HIT family protein  41.57 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000194995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0645  HIT family protein  41.57 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710246  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  31.9 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  34.45 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf126  HINT (histidine triad nucleotide-binding protein) family member  38.61 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0702  hydrolase, HIT family  36.79 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  35.24 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  34.29 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  31.06 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  32.74 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  30.91 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  25.56 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  31.86 
 
 
139 aa  66.6  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  31.09 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  32.17 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  30 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  33.59 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  34.45 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  34.45 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  25.9 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  25.9 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  28.68 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  28.57 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  35.24 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  28.06 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  32.77 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  27.93 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  25.64 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  31.5 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  28.79 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  31.5 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  31.5 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  31.5 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  31.5 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  31.5 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  31.5 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17710  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.21 
 
 
165 aa  62.8  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  31.5 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  31.82 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  31.5 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  28.36 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  28.15 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  28.32 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  28.68 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  30.71 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  29.81 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  33.98 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  27.48 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  29.13 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  29.13 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  35.24 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  31.3 
 
 
455 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3348  histidine triad  35.79 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  31.58 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  33.98 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  31.07 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  29.73 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  29.52 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  28.15 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  30.19 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  25.47 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  22.63 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  30.39 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  26 
 
 
143 aa  58.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  30.21 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  32.08 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  31.07 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  27.86 
 
 
145 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>