148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1698 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 220 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  54.17 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  40.21 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  41.45 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  43.68 
 
 		 324 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  43.14 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  43.62 
 
 		 260 aa  88.6  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  40.74 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  42.41 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  44.59 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  38.1 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  41.48 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  44.62 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.09 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  41.43 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  43.08 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  34.69 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  41.86 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  37.32 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.12 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  41.91 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  36.69 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  46.41 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  37.16 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4026  peptidase A24A prepilin type IV  46.51 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369556  hitchhiker  0.00138175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  34 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3139  peptidase A24A prepilin type IV  42.96 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3154  peptidase A24A prepilin type IV  44.74 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  30.6 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.79 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  32.88 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  31.65 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  34.07 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  30.64 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  30.37 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.8 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  32.37 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  31.88 
 
 		 283 aa  51.6  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  35.64 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  28.89 
 
 		 304 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  26.95 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.82 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  34.78 
 
 		 296 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  33.87 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  27.69 
 
 		 308 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  30.94 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  27.69 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  39.86 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  36.49 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  27.41 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  27 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  28.77 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  31.82 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.74 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  34.65 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  27.22 
 
 		 308 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  27.74 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4469  peptidase A24A prepilin type IV  36.84 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  25.14 
 
 		 305 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  36.05 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  35.62 
 
 		 288 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  29.58 
 
 		 289 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.51 
 
 		 308 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  47.62 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  33.09 
 
 		 288 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  26.95 
 
 		 274 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  32.59 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  30.5 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.94 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  32.21 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1357  late competence protein comC  31.54 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  35.33 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  34.67 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  34.52 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  34.74 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  33.68 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.15 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  28.38 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  35.38 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  38.1 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  32.7 
 
 		 303 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  25.34 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  29.61 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  42.71 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  31.54 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  35.62 
 
 		 293 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  33.59 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.62 
 
 		 293 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  40.58 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  27.62 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  27.34 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  34.35 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  31.54 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  31.34 
 
 		 318 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  34.93 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.09 
 
 		 308 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  30.82 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  29.37 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  34.35 
 
 		 303 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>