More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4238 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  786    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  30.73 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.93 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 421 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  24.05 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.54 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.8 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 426 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 451 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 417 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.07 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.07 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.07 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.07 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.21 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.69 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.46 
 
 		 430 aa  90.1  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 439 aa  89.7  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.51 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  29.4 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  27.55 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  27.55 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  27.55 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.87 
 
 		 1833 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  26.82 
 
 		 1816 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  27.53 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.23 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.5 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.56 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.13 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  24.13 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  26 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  26 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>