More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0929 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0929  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 317 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.345522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  75.42 
 
 		 311 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  55.22 
 
 		 281 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  37.88 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3470  alpha/beta hydrolase fold protein  36.5 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304783  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  26.28 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.37 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.59 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.95 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  37.5 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  26.46 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  21.92 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  38.14 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  25.44 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  31.39 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  26.11 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  33.86 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.74 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.15 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.47 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  34.11 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.77 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.03 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  24.29 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  34.38 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>